Střetem zájmu Andreje Babiše se nezabývaly jen evropské audity, ale i domácí úřady. V srpnu 2018 podala organizace Transparency International podnět k prošetření podezření ze spáchání přestupku porušení zákona o střetu zájmů, jelikož premiér nadále ovládá média spadající pod holding Agrofert.
Městský úřad v Černošicích dvakrát rozhodl v Babišův neprospěch a vyměřil mu pokutu 200 tisíc korun. Babišovi právníci se v rámci odvolání obrátili na Krajský úřad Středočeského kraje, který jim dal naopak za pravdu. Premiérovo vlastnictví mediálních společností Londa (Rádio Impuls…) a Mafra (Mladá fronta DNES, Lidové noviny…) je prý neprůkazné a v září 2019 definitivně zastavil přestupkové řízení.
Situaci mohl zvrátit nejvyšší státní zástupce Pavel Zeman, jenž má v pravomoci podat správní žalobu, aby tento problém rozřešil nezávislý soud.
Nejvyšší státní zastupitelství zveřejnilo 8. července 2020 strohou tiskovou zprávu, kde oznámilo, že se Pavel Zeman rozhodl správní žalobu nepodat se sporným odůvodněním, že v této věci neshledal závažný veřejný zájem. Nezveřejnil podrobné stanovisko a jeho netransparentní přístup vyvolal úvahy, zda si už Babišovo impérium nepodmanilo i státní zastupitelství.
Není veřejný zájem?
Zemanovo rozhodnutí vyvolalo vlnu kritiky. Co závažnějšího může být předmětem veřejného zájmu, než podezření ze střetu zájmů předsedy vlády, jímž se v souvislosti s dotacemi Agrofertu bezprecedentně zabývají i evropské instituce?
Důvodů podat správní žalobu by se našlo dost, přičemž záleží čistě na úvaze nejvyššího státního zástupce. Obsah tohoto pojmu řeší četná judikatura. V tomto případě by závažným veřejným zájmem mohly být důvody ochrany rovnosti politické soutěže, objektivity médií vlastněných významným politikem, ale i ochrany nezávislého rozhodování správních orgánů.
Středočeský kraj vedla hejtmanka Jaroslava Pokorná Jermanová, současně místopředsedkyně hnutí ANO, o jehož šéfovi úřad rozhodoval. Neponechala nic náhodě, včas provedla reorganizaci krajského úřadu a vyměnila zaměstnance, kteří se zabývali odvoláním. O nezávislém výkonu státní správy, nepodléhajícímu politickému vlivu, nemohla být řeč.
Za veřejný zájem mohou být považovány také nelegální úniky informací ze živých policejních spisů do médií. Tyto praktiky jsou běžným arzenálem deníků Mladá fronta DNES a Lidové noviny, sloužících jako převodová páka k útokům na politickou a byznysovou konkurenci Andreje Babiše.
Postup Pavla Zemana je o nesrozumitelnější, že později vyšlo najevo, že s verdiktem středočeského krajského úřadu nesouhlasil. Přesto se rozhodl správní žalobu nepodat, což mohlo být interpretována jako jeho snaha nevyhrocovat vztahy s vládou.
Závěrečná zpráva evropského auditu, konstatující premiérův střet zájmů s přímým dopadem na dotace Agrofertu, dala za pravdu černošickým úředníkům. Jelikož po krajských volbách v říjnu 2020 došlo ke změně vedení Středočeského kraje, podala Transparency International nový podnět k přestupkovému řízení.